يستخدم دواء كارنيتول في نقص الكارنيتين عند حديثي الولادة نتيجة لبعض الاضطرابات في عمليات التمثيل الغذائي لديهم، نقص الكارنيتين المرتبط بعمليات الغسيل الكلوي لدى مرضى الفشل الكلوي الحاد، تحسين صحة وحركة الحيوانات المنوية، مما يساهم
كارنيتول في تحسين الخصوبة لدى الرجال، مرضى السكري من النوع الثاني، ضعف عضلة القلب، ضعف العضلات الهيكلية، فقدان الكتلة العضلية الناجم عن سوء التغذية.